ССКЦ был организован по постановлению Президиума СО РАН на базе института ИВМиМГ СО РАН в марте 2001 года.

Основными задачами ССКЦ являются:

• обеспечение исследователей - сотрудников научных институтов СО РАН, ВУЗов Сибири, грантодержателей РФФИ, Миннауки, Минобразования России современными вычислительными средствами для работ по математическому моделированию в фундаментальных и прикладных исследованиях механики, физики, химии, геологии, биологии и других дисциплин;

• организация обучения специалистов СО РАН и студентов ВУЗов методам параллельных вычислений на суперкомпьютерах ;

• взаимодействие с другими Суперкомпьютерными центрами СО РАН, Москвы,  других городов России, а также зарубежных стран, совместная разработка технологий распределенных вычислений.